小麦二所主要从事农作物的高产栽培和小麦育种工作，2010年由农业部批准设立了国家小麦产业技术体系宿州综合试验站。科室现有职工8人，其中研究员1名、副研究员1名、研究实习员3名，技师1名、中级技工2名。主要科研成果有：“淮北地区小麦需肥规律及高效施肥的技术研究”获1995年安徽省科技进步三等奖；“砂浆黑土小麦高产400kg综合栽培技术途径的研究”获1993年市科技进步三等奖；“淮北地区小麦-玉米吨粮田栽培体系研究”获1998年安徽省科技进步三等奖；“淮北优质小麦高产高效栽培理论及技术体系研究”，获2000年安徽省科技进步三等奖；“淮北地区优质专用小麦高产栽培技术研究” 获2001年宿州市“313富民工程”突出贡献奖。正在主持国家科技支撑计划“粮丰工程--淮北东北部（灵璧）旱作茬小麦丰产优质栽培技术集成与示范”课题，宿州市重点项目“高产优质小麦新品种选育及技术优化”和“棉花高产优质棉花新品种选育”等课题。选育成小麦新品种皖麦68一个，新品系皖宿0217、皖宿0205和皖宿0316现在安徽省小麦区域试验和联合鉴定中。