植物保护研究所主要从事农作物病虫草等有害生物的发生规律、防治方法、农药应用，农产品安全生产，农作物绿色高产栽培技术研究及社会化服务等工作。当前主要承担玉米田、大豆田苗后除草剂减量化试验；小麦田蚜虫、赤霉病防治试验、示范；国家芝麻区域试验（江淮片），芝麻绿色高产栽培技术研究。在此基础上，与有关企业、研究院所、植保部门广泛开展合作研究，为企业、农户提供了大量的科技信息和实用技术。现有专业技术人员5人，其中研究员1名、副研究员1人、研究实习员2人，高级工1名。